Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SETD1BQ9UPS6 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms