Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms