Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms