Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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