Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOL4Q9BPW4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms