Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf72Q96LT7 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms