Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms