Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RSPRY1Q96DX4 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms