Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00523Q86TU6 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00523Q86TU6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00523Q86TU6 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00523Q86TU6 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00523Q86TU6 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00523Q86TU6 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00523Q86TU6 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00523Q86TU6 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00523Q86TU6 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00523Q86TU6 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00523Q86TU6 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00523Q86TU6 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00523Q86TU6 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00523Q86TU6 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00523Q86TU6 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00523Q86TU6 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00523Q86TU6 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00523Q86TU6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00523Q86TU6 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00523Q86TU6 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00523Q86TU6 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00523Q86TU6 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00523Q86TU6 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00523Q86TU6 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00523Q86TU6 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00523Q86TU6 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00523Q86TU6 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00523Q86TU6 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00523Q86TU6 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00523Q86TU6 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00523Q86TU6 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms