Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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