Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
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