Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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PCK2Q16822 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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