Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIP13Q15645 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms