Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SIX1Q15475 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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SIX1Q15475 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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SIX1Q15475 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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SIX1Q15475 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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