Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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