Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HNF4GQ14541 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 267.5 ms