Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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COL4A6Q14031 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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COL4A6Q14031 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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COL4A6Q14031 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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COL4A6Q14031 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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COL4A6Q14031 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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COL4A6Q14031 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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COL4A6Q14031 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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COL4A6Q14031 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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COL4A6Q14031 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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COL4A6Q14031 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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