Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms