Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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