Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms