Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 ST3GAL5-204ENST00000393808 2236 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 VAV1-207ENST00000599806 2717 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 KIF9-207ENST00000444589 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
CD300CQ08708 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CD300CQ08708 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms