Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PPP3CAQ08209 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms