Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms