Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ERVS71-1P61550 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms