Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLE2P56282 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLE2P56282 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLE2P56282 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLE2P56282 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms