Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DUSP1P28562 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
DUSP1P28562 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms