Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms