Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MMP10P09238 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MMP10P09238 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MMP10P09238 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MMP10P09238 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MMP10P09238 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MMP10P09238 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MMP10P09238 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MMP10P09238 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MMP10P09238 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MMP10P09238 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MMP10P09238 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MMP10P09238 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MMP10P09238 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MMP10P09238 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MMP10P09238 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MMP10P09238 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MMP10P09238 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MMP10P09238 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms