Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEP104O60308 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEP104O60308 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms