Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms