Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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KLHL13Q9P2N7 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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KLHL13Q9P2N7 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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