Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
CTNNBIP1Q9NSA3 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms