Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
ARHGAP35Q9NRY4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP35Q9NRY4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms