Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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IFT27Q9BW83 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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IFT27Q9BW83 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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IFT27Q9BW83 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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IFT27Q9BW83 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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