Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms