Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms