Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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ATG16L1Q676U5 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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