Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms