Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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RAB35Q15286 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB35Q15286 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB35Q15286 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB35Q15286 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB35Q15286 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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RAB35Q15286 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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RAB35Q15286 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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RAB35Q15286 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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RAB35Q15286 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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RAB35Q15286 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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RAB35Q15286 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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RAB35Q15286 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB35Q15286 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB35Q15286 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB35Q15286 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB35Q15286 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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