Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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