Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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BNIP1Q12981 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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BNIP1Q12981 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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BNIP1Q12981 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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BNIP1Q12981 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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BNIP1Q12981 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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BNIP1Q12981 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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BNIP1Q12981 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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BNIP1Q12981 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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BNIP1Q12981 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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BNIP1Q12981 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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BNIP1Q12981 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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