Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 SGK1-217ENST00000490149 873 ntTSL 25.92□□□□□ -1.464e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.464e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RNF10-218ENST00000543578 548 ntTSL 45.88□□□□□ -1.474e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 EIF3M-204ENST00000525054 592 ntTSL 25.81□□□□□ -1.484e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.54e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 PTK2-221ENST00000520460 572 ntTSL 45.7□□□□□ -1.54e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 SGK1-227ENST00000532021 696 ntTSL 35.66□□□□□ -1.54e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.534e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 EIF3M-206ENST00000526267 662 ntTSL 25.34□□□□□ -1.554e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 ZNF638-222ENST00000491843 332 ntTSL 35.3□□□□□ -1.561e-8■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL7-205ENST00000431653 563 ntTSL 35.17□□□□□ -1.584e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.594e-12■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.64e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.624e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RBMS1-208ENST00000474147 2854 ntTSL 24.85□□□□□ -1.634e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.674e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RBMS1-209ENST00000474820 4016 ntTSL 1 (best)4.63□□□□□ -1.674e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.671e-8■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 MGA-205ENST00000564190 3521 ntTSL 24.52□□□□□ -1.694e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 SGK1-212ENST00000475882 615 ntTSL 34.36□□□□□ -1.714e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.714e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.764e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RBMS1-213ENST00000490637 4078 ntTSL 23.91□□□□□ -1.784e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.794e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL7-206ENST00000435330 445 ntTSL 33.86□□□□□ -1.794e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 HJURP-206ENST00000434039 385 ntTSL 53.76□□□□□ -1.814e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.914e-12■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 SGK1-221ENST00000525700 541 ntTSL 43□□□□□ -1.934e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 SGK1-218ENST00000524387 576 ntTSL 42.97□□□□□ -1.934e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 SGK1-225ENST00000531575 576 ntTSL 41.38□□□□□ -2.194e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 ACTN4-210ENST00000588618 1729 ntTSL 1 (best)21.77■■□□□ 1.086e-8■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 A2M-205ENST00000472360 692 ntTSL 25.91□□□□□ -1.464e-32■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 IARS-207ENST00000467876 298 ntTSL 33.2□□□□□ -1.95e-8■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 ETV4-209ENST00000587151 582 ntTSL 512.62□□□□□ -0.396e-10■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 PTMS-205ENST00000540828 644 ntTSL 1 (best)18.53■□□□□ 0.561e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.481e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.461e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 PTMS-203ENST00000538057 976 ntTSL 215.07■□□□□ 01e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.031e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 PTMS-204ENST00000540667 820 ntTSL 212.17□□□□□ -0.461e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 PCBP2-219ENST00000550733 754 ntTSL 26.87□□□□□ -1.312e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 TTC3-207ENST00000418766 3771 ntTSL 518.26■□□□□ 0.511e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 TTC3-209ENST00000438055 3606 ntTSL 518.19■□□□□ 0.51e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 TTC3-219ENST00000485402 3626 ntTSL 516.39■□□□□ 0.211e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL13-203ENST00000399461 879 ntTSL 219.47■□□□□ 0.713e-13■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 CTBP1-214ENST00000514495 564 ntTSL 224.01■■□□□ 1.434e-15■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 CTBP1-217ENST00000515399 985 ntTSL 317.79■□□□□ 0.444e-15■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 CTBP1-213ENST00000514210 856 ntTSL 213.94□□□□□ -0.184e-15■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 CTBP1-212ENST00000513420 704 ntTSL 312.56□□□□□ -0.44e-15■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 KIAA0100-202ENST00000528896 7407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.857e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.997e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.027e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 NPC1L1-204ENST00000546276 4826 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.259e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 NPC1L1-201ENST00000289547 5048 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.399e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 NPC1L1-202ENST00000381160 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.419e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 TTYH3-202ENST00000400376 560 ntTSL 416.02■□□□□ 0.164e-8■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 SORBS3-208ENST00000520207 576 ntTSL 217.07■□□□□ 0.322e-17■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 SORBS3-204ENST00000517962 885 ntTSL 211.35□□□□□ -0.592e-17■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 SNX5-216ENST00000494401 656 ntTSL 55.52□□□□□ -1.536e-9■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.442e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 MAT2A-205ENST00000481412 1438 ntTSL 1 (best)12.86□□□□□ -0.352e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 MAT2A-201ENST00000306434 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.852e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.5□□□□□ -2.011e-323■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.343e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.033e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.133e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 UBP1-212ENST00000492136 7394 ntTSL 27.68□□□□□ -1.183e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 UBP1-207ENST00000466441 927 ntTSL 1 (best)4.87□□□□□ -1.633e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 UBP1-206ENST00000464787 536 ntTSL 34.76□□□□□ -1.653e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 UBP1-203ENST00000411650 859 ntTSL 54.1□□□□□ -1.753e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 UBP1-210ENST00000486388 928 ntTSL 33.83□□□□□ -1.83e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 WDR27-202ENST00000441385 683 ntTSL 39.56□□□□□ -0.881e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.872e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 HMBS-212ENST00000542044 1544 ntTSL 518.62■□□□□ 0.572e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.512e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.342e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.332e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 HMBS-226ENST00000640813 1283 ntTSL 516.34■□□□□ 0.212e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.22e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 HMBS-224ENST00000546226 2112 ntTSL 216.28■□□□□ 0.22e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 HMBS-222ENST00000545621 1282 ntTSL 1 (best)14.42□□□□□ -0.12e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 HMBS-219ENST00000544182 1542 ntTSL 213.45□□□□□ -0.262e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 HMBS-202ENST00000392841 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.482e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.582e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 HMBS-217ENST00000543543 1796 ntTSL 510.81□□□□□ -0.682e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 ILF3-204ENST00000585835 849 ntTSL 311.74□□□□□ -0.536e-12■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.353e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.113e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 PSMD11-205ENST00000493026 2387 ntTSL 213.35□□□□□ -0.273e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 PSMD11-203ENST00000469475 473 ntTSL 212.85□□□□□ -0.353e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RBM25-205ENST00000527432 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.786e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.046e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RBM25-212ENST00000532683 6848 ntTSL 1 (best)6.72□□□□□ -1.336e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RBM25-207ENST00000528081 3008 ntTSL 26.42□□□□□ -1.386e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 MLXIPL-207ENST00000453275 690 ntTSL 517.25■□□□□ 0.351e-12■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.424e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.484e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 SAP30BP-220ENST00000583329 998 ntTSL 312.44□□□□□ -0.424e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 SAP30BP-207ENST00000578756 652 ntTSL 210.95□□□□□ -0.664e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 SAP30BP-216ENST00000581385 253 ntTSL 20.92□□□□□ -2.264e-6■■□□□ 11.7
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