Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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