Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms