Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPIBQ01892 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms