Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAGEA3P43357 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAGEA3P43357 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAGEA3P43357 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAGEA3P43357 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MAGEA3P43357 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAGEA3P43357 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAGEA3P43357 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAGEA3P43357 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAGEA3P43357 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MAGEA3P43357 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MAGEA3P43357 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAGEA3P43357 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAGEA3P43357 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MAGEA3P43357 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAGEA3P43357 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAGEA3P43357 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAGEA3P43357 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAGEA3P43357 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
MAGEA3P43357 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MAGEA3P43357 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAGEA3P43357 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAGEA3P43357 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAGEA3P43357 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MAGEA3P43357 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MAGEA3P43357 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MAGEA3P43357 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MAGEA3P43357 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAGEA3P43357 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MAGEA3P43357 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MAGEA3P43357 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
MAGEA3P43357 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MAGEA3P43357 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MAGEA3P43357 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MAGEA3P43357 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAGEA3P43357 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms