Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASQ1P31415 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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