Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP1P29466 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP1P29466 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP1P29466 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP1P29466 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP1P29466 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP1P29466 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP1P29466 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP1P29466 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP1P29466 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP1P29466 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP1P29466 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP1P29466 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP1P29466 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP1P29466 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP1P29466 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP1P29466 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP1P29466 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP1P29466 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP1P29466 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP1P29466 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP1P29466 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP1P29466 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP1P29466 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP1P29466 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP1P29466 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms