Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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