Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms